Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Swt1Q9DBQ9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Swt1Q9DBQ9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms