Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Cldn22Q9D7U6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn22Q9D7U6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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