Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rep15Q9D7T1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rep15Q9D7T1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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