Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lonrf3Q9D4H7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms