Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syf2Q9D198 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms