Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snf8Q9CZ28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms