Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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