Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rpl11Q9CXW4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms