Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nip7Q9CXK8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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