Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc3Q9CXE6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Xrcc3Q9CXE6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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