Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ddx28Q9CWT6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ddx28Q9CWT6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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