Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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