Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tlr3Q99MB1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tlr3Q99MB1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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