Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp16Q99LG0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp16Q99LG0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms