Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RtcbQ99LF4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms