Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps4Q99KG7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hps4Q99KG7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hps4Q99KG7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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