Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp11Q99K46 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usp11Q99K46 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp11Q99K46 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp11Q99K46 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp11Q99K46 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp11Q99K46 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp11Q99K46 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp11Q99K46 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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