Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnaaf4Q8R368 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaaf4Q8R368 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms