Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Vrk3Q8K3G5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vrk3Q8K3G5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Vrk3Q8K3G5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vrk3Q8K3G5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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