Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms