Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg4aQ8C9S8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Atg4aQ8C9S8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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