Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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