Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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