Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms