Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms