Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod1Q8BVA4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms