Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pum3Q8BKS9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pum3Q8BKS9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pum3Q8BKS9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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