Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4bQ8BGE6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg4bQ8BGE6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atg4bQ8BGE6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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