Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Htatsf1Q8BGC0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms