Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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