Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nup98Q6PFD9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup98Q6PFD9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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