Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
BC061212Q6P8K3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms