Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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NipblQ6KCD5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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