Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sptbn2Q68FG2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms