Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Phox2aQ62066 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms