Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms