Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms