Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Traf3Q60803 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Traf3Q60803 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Traf3Q60803 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Traf3Q60803 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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