Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf3Q60765 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf3Q60765 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms