Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sin3aQ60520 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms