Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Tsr1Q5SWD9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tsr1Q5SWD9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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