Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ankrd53Q3V0J4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms