Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sf3b2Q3UJB0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms