Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Kdm4dQ3U2K5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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