Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms