Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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