Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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