Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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