Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fam107bQ3TGF2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Fam107bQ3TGF2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam107bQ3TGF2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms