Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn2bQ0KL01 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms